内容编辑SSR/STR检测
分类: 分子标记
发布时间: 2015-04-28 22:17
微卫星标记（Microsatellite）也称为短串联重复序列（STR）或简单重复序列（SSR），是广泛分布在真核生物基因组中的简单重复序列。微卫星位点通常通过PCR扩增和毛细管电泳（比传统的聚丙烯电泳法快捷、准确），并根据片段大小分离等位基因进行分析。毛细管电泳检测是将扩增后的等位微卫星利用ABI3730分析仪对荧光标记的DNA片段进行检测，结合分子量内标进行DNA片段长度计算，使SSR/STR分型变得高效快捷、精确。
实验原理
SSR(Simple Sequence Repeats)标记是近年来发展起来的一种以特异引物 PCR 为基础的分子标记技术，也称为微卫星 DNA(MicrosatelliteDNA),是一类由几个核苷酸（一般为 1~6 个）为重复单位组成的长达几十个核苷酸的串联重复序列。由于每个 SSR 两侧的序列一般是相对保守的单拷贝序列。研究发现，微卫星中重复单位的数目存在高度变异，这些变异表现为微卫星数目的整倍性变异或重复单位序列中的序列有可能不完全相同。
技术优势
1. 数量丰富，覆盖整个基因组，揭示的多态性高；
2. 具有多等位基因的特性，提供的信息量高；
3. 以孟德尔方式遗传，呈共显性；
4. 每个位点由设计的引物顺序决定，便于不同的实验室相互交流合作开发引物。
应用领域
1. 遗传图谱的构建;
2. 目标基因的标定;
3. 指纹图的绘制;
4. 品种鉴定;
5. 谱系分析;
6. 群体间遗传距离分析;
7. 进化和遗传多样性。
样本类型
植物：叶、茎、皮、花、果实、种子、块根、干样本、中药材等；
动物：组织、细胞、血液、干血斑、拭子、骨骼、唾液、石蜡切片、毛囊、粪便、尿液、分泌物、法医检材等；
微生物：真菌、细菌，土壤、粪便等；
藻类：硅藻、蓝藻、绿藻、褐藻等。
植物：叶、茎、皮、花、果实、种子、块根、干样本、中药材等；
动物：组织、细胞、血液、干血斑、拭子、骨骼、唾液、石蜡切片、毛囊、粪便、尿液、分泌物、法医检材等；
微生物：真菌、细菌，土壤、粪便等；
藻类：硅藻、蓝藻、绿藻、褐藻等。
送样要求
1. 样本本身DNA无明显降解。可提供新鲜材料，冻存材料或样本保护液保存的材料。建议使用样本保护液采集和保存样本，可常温下运输样本，方便操作，DNA质量更好;
2. 完整准确填写样本信息表，干冰运输（使用样本保护液的样本无需干冰运输）;
3. 样本无传染性、无致病性;
4. 基因信息、待测位点、序列或引物。
1. 样本本身DNA无明显降解。可提供新鲜材料，冻存材料或样本保护液保存的材料。建议使用样本保护液采集和保存样本，可常温下运输样本，方便操作，DNA质量更好;
2. 完整准确填写样本信息表，干冰运输（使用样本保护液的样本无需干冰运输）;
3. 样本无传染性、无致病性;
4. 基因信息、待测位点、序列或引物。