内容编辑ISSR检测
分类: 分子标记
发布时间: 2015-04-28 22:17
ISSR（inter-simple sequence repeat）标记是一种利用包含简单重复序列（SSR）并在3’或5’锚定的单寡聚核酸引物对基因组进行扩增的标记系统，即用SSR引物来扩增重复序列之间的区域。重复序列和锚定碱基是随机选择的，扩增产物经毛细管电泳（比传统的聚丙烯电泳法快捷、准确）分离后，每个引物可以产生比RAPD方法更多的扩增片段。因此，ISSR标记是一种快速、可靠、可以提供有关基因组丰富信息的分子标记技术，现已广泛用于植物品种鉴定、遗传作图、基因定位、遗传多样性、进化及分子生态学研究中。
实验原理
ISSR标记根据生物广泛存在SSR的特点，利用在生物基因组常出现的SSR本身设计引物，无需预先克隆和测序。用于扩增的引物一般为16-18个碱基序列，由1-4个碱基组成的串联重复和几个非重复的锚定碱基组成，从而保证了引物与基因组DNA中SSR的5’或3’末端结合，导致位于反向排列、间隔不太大的重复序列间的基因组节段进行PCR扩增。然后使用毛细管电泳对荧光标记的DNA片段进行检测，使ISSR分型变得高效快捷、精确。
应用领域
1. 遗传图谱的构建;
2. 目标基因的标定;
3. 指纹图的绘制;
4. 品种鉴定;
5. 谱系分析;
6. 群体间遗传距离分析;
7. 进化和遗传多样性。
样本类型
植物：叶、茎、皮、花、果实、种子、块根、干样本、中药材等；
动物：组织、细胞、血液、干血斑、拭子、骨骼、唾液、石蜡切片、毛囊、粪便、尿液、分泌物、法医检材等；
微生物：真菌、细菌，土壤、粪便等；
藻类：硅藻、蓝藻、绿藻、褐藻等。
植物：叶、茎、皮、花、果实、种子、块根、干样本、中药材等；
动物：组织、细胞、血液、干血斑、拭子、骨骼、唾液、石蜡切片、毛囊、粪便、尿液、分泌物、法医检材等；
微生物：真菌、细菌，土壤、粪便等；
藻类：硅藻、蓝藻、绿藻、褐藻等。
送样要求
1. 样本本身DNA无明显降解。可提供新鲜材料，冻存材料或样本保护液保存的材料。建议使用样本保护液采集和保存样本，可常温下运输样本，方便操作，DNA质量更好;
2. 完整准确填写样本信息表，干冰运输（使用样本保护液的样本无需干冰运输）;
3. 样本无传染性、无致病性;
4. 基因信息、待测位点、序列或引物。
1. 样本本身DNA无明显降解。可提供新鲜材料，冻存材料或样本保护液保存的材料。建议使用样本保护液采集和保存样本，可常温下运输样本，方便操作，DNA质量更好;
2. 完整准确填写样本信息表，干冰运输（使用样本保护液的样本无需干冰运输）;
3. 样本无传染性、无致病性;
4. 基因信息、待测位点、序列或引物。